No atual estágio de desenvolvimento tecnológico, o processo de produção de melhor relação entre economicidade e eficiência é pela rota da alcoólise alcalina.
Considerando-se a obtenção de ésteres etílicos, a forma de processamento mais adequada é a transesterificação usando-se soda cáustica como catalisador e podendo obter, alem do éster como produto principal, o glicerol e sabões ou ácidos graxos líquidos como subprodutos. A cada 1% de soda caustica usada como catalisador, vão ser originados cerca de 7%, de sabões em reação com a matéria graxa, dos quais se poderá recuperar cerca de 6%, em peso do total inicial de matéria graxa. No entanto, as instalações de recuperação de ácidos graxos e de glicerina custam muito mais caro do que a própria instalação de transterificação semicontinua ou descontinua.
Instalações como as mini-usinas podem ser alocadas em áreas distantes, assim como em ilhas energéticas, operadas industrialmente pelo biodiesel de própria fabricação e produzindo combustível para uso local. Este sistema associado ao conceito de pequenas centrais em cooperativismo constrói um cenário favorável para pequena geração nas regiões norte e nordeste. Neste caso, há que se criar as condições necessárias à garantia do atendimento às especificações A unidade industrial da Petrobrás em construção no Rio Grande do Norte, operará com 10 toneladas de mamona por dia, produzindo 5,6 metros cúbicos de biodiesel, transesterificado a partir da semente da mamona, sem passar pela produção do óleo.
Há know-how para o desenvolvimento de tecnologia nacional para plantas industriais de biodiesel, a exemplo do parque já instalado para a indústria de açúcar e álcool. Empresas nacionais esboçam planos para investimento nessa tecnologia, inclusive com financiamento próprio. Desenvolvimento de sistemas para instrumentação de controle de processo e alguns equipamentos específicos como centrífugas podem ser objeto de desenvolvimento tecnológico.